ژنرال احمد یک ارتش مردمی را در مرکز شهر راه اندازی کرده است تا از رنج و بدبختی شهروندان محله واتس بکاهد. وقتی اراذل و اوباش مافیا فشارها را بر مردم محلی افزایش می‌دهند، سرهنگ کوجاه، معاون احمد، اجازه می‌خواهد تا یک گروه حفاظتی برای اقدام مستقیم‌تر تشکیل دهد. احمد نگران است که این گروه حفاظتی به یک باند خودسر و بی‌قانون تبدیل شود و پیش‌بینی او به زودی به حقیقت می‌پیوندد. آیا احمد می‌تواند کنترل را از کوجاه تشنه قدرت پس بگیرد، یا خود قربانی بعدی این باند خواهد شد؟

در فوریه ۱۹۶۲، هم‌زمان با رسیدن جنبش حقوق مدنی به بایون در لوئیزیانا، یک روزنامه‌نگار نیویورکی برای مصاحبه با جین پیتمن که تازه ۱۱۰ ساله شده است، وارد این شهر می‌شود. او داستان زندگی خود را که به اولین خاطراتش پیش از پایان دوران برده‌داری بازمی‌گردد، برای او تعریف می‌کند. در میان فصل‌های مختلف زندگی او، مبارزات امروزی سیاه‌پوستان در بایون که به تشویق جیمی شکل گرفته است، به تصویر کشیده می‌شود.

قهرمانان فیلم «پدرخوانده سیاه» اعضای یک سازمان جنایی آفریقایی-آمریکایی هستند. آن‌ها مانند براندو در «پدرخوانده»، با سرقت و قتل مخالف نیستند، اما خط قرمزشان مواد مخدر است. وقتی مافیا با مواد مخدر خطرناک به محله نفوذ می‌کند، پدرخوانده سیاه (راد پری) به زیردستانش دستور می‌دهد تا به این خیانت پایان دهند.